翡翠是具有纤维交织结构的多晶聚集体。它所含的翡翠矿物在光线下会有白色反射。我们称之为祖母绿，也称为苍蝇翅。当这些微小的反射表面聚集在一起时，它们会在肉眼中显示点状或线状的白色棉絮，我们称之为棉花。换句话说，棉花是翡翠结晶粒子的边界线。这是翡翠的独特功能。可以说，不管翡翠有多好，它们都是棉制的，但肉眼看得见的却不同。晶体颗粒越粗，棉花越明显。透明度也是一个关键因素。我们越透明，就越能看到棉花。如果我们完全不透明，我们就不能用肉眼看到棉花。因此，棉花不影响翡翠中的价值。在棉花的穿着过程中，随着人体油脂和汗水逐渐渗透到这些边界的中间，改变其折射方向，肉眼就不那么明显了。
翡翠在它的形成过程中经历了无数次的地质运动，无数次的挤压、碰撞、拉扯导致翡翠本身的结晶遭到破坏，形成了裂痕。一部分裂痕随着时间的沉淀渐渐愈合，恢复原有的牢固性，但是却留下疤痕，这就是愈合裂隙，我们俗称的石纹。石纹也是翡翠中极其常见的现象，行内也称十玉九纹。在天然的毛料里几乎每一块完整的毛料里都有石纹。在这里不得不说雕刻师的心灵手巧，他们用智慧和巧手避开裂纹，尽量减少石纹，所以我们现在所见的翡翠成品中石纹已经是无法避免，所剩不多的了。疤痕确实影响美观，但是它并不是翡翠的致命伤，石纹其实并不影响翡翠的牢固性。很多人误以为石纹处很容易断裂，其实在翡翠雕刻的抛光过程中它已经经历了钻头每秒几千转带来的剧烈震荡，如果真是不堪一击的话在雕刻过程中已经断裂。如果受到强烈撞击，即使没有石纹的依然会断裂，如果不受到强烈撞击，有石纹也不会断裂。
翡翠成矿中会有次生色侵入晶格形成漂亮的颜色。如果是进入晶格之间距离较大的部分，就会形成颜色较深的脉状形态就是色根。色根大多数呈褐黄色，墨绿色甚至接近黑色。在一部分成品中看起来有些影响美观，但其实只是有色元素聚集的位置。有说法说翡翠会越戴越绿，就是源自于色根中的铬离子会渐渐渗透在晶格间隙之中，并不是说白的翡翠可以戴成绿色。不过这个过程比起棉的消散还要漫长得多。如果是次生矿物侵入愈合裂隙的话，就会看见点状的黑色物质，这些物质大多是二价铁或者三价铁的化合物，其实杂质中的铁元素对人体是很有好处的。虽然可能影响美观，但其实有较好的保健作用。翡翠的灵性表现在于它的独一无二，也体现在这些与人体有极为相似的地方，人无完人，玉无完玉，正视所谓的瑕疵是非常有必要的。只有正视这些才能更好的认识玉石，才能选出最合适自己的宝玉。
